五队为一旅，设立参领管理。五旅为一佐，设副都统管理。诸部头人受封为同知，只能管民务。军务则由朝廷从诸部之中，挑选的将军管理。诸部头人，只有管理本旗民务的权利。并不能干涉州府权利。其属下旗民可以享受不缴纳钱粮的权利，但必须要完全服从朝廷征调。
并且在当地设置官府，治理汉人或是渤海人。对其子弟学习汉文优秀者，则采取恩萌入誓办法授予官职。并从其诸部子弟之中，挑选优秀子弟送到国子监学习一定时日后，授予官职。这一种即与青塘吐蕃诸旗有些类似，但又不完全相同的办法。是在黄琼离开辽阳府之前，黄瑞枫反复与其商量之后决定的。这其中其中还采取了部分，北辽对这些民族的治理手段。
活动在按出虎水流域的女真完颜部，在黄瑞枫宣布这个处置办法后，其几部首领当即便拒绝了朝廷的条件。为了给女真与室韦诸部以警示，黄瑞枫事后便调集重兵，将完颜三部彻底剿灭。俘获的女子赏赐给有功将士为妾，男子则全部斩杀。整个完颜三部，被杀了一个干干净净。其他诸部，便是心有不甘。但再也不敢与朝廷对抗，老老实实接受朝廷的册封与安置。
黄瑞枫又与诸部首领约定，其头人每三年到京城面君。这又拉又打，还采取了杀一只猴子，震慑群鸡的做法，将北方诸部稳定下来。同时，在北方诸部族之中，大力推广佛教。对于大漠草原上的诸部，则推行青塘吐蕃的盟旗制度。鼓励其改变原本信仰的萨满教，改为信仰喇嘛教。对于信仰喇嘛教的部族，朝廷在设置盟旗方面，将会给与一定的照顾，俸禄上也多。
相对于大漠草原与白山黑水诸部，杨继元虽打退了高丽对保州进攻，并攻下了北辽设置在辽东最后一块地盘镇海府诸州县。但在接下来对高丽本土的进攻之中，却是遇到了高丽军的顽强抵抗。尽管利用大炮的优势，连续攻下了高丽数座城池，甚至攻下了高丽西京，并全歼八千高丽援军，可总体上推进还是有些缓慢。而且在行军途中，还多次遭遇到高丽军设伏。
失去耐心的杨继元，于当年季风起。调集已经进驻山东路的一万步军、三千马军，由从大理国调回后，便任山东水师提督张德亲自指挥。扬帆出海，从山东路渡海北上。面对海州严密死守高丽军，张德也不屑与其争夺。将所辖舰艇调头，以侧舷舰炮直接就是一排炮弹上去。一顿霹雳震弹加上实心弹下去，高丽海州守军以及那点水师，连点浪花都没有掀起。
在拿下海州后，担心开京高丽君臣，像北辽三次征伐那般开溜的张德。连海州都没有进，以马军为先导率先切断开京南下的道路，步军携带大炮与辎重随后跟进。水师中舰船，则携带步军携带不易的重炮与粮草，以及一千步军沿着礼成江溯流而上。还没有等到开京内的高丽君臣反应过来，不仅南下道路已经被切断，随后赶上的齐军步军，将开京城严密的合围。
在完成合围之后，张德利用沿着礼成江溯流而上船只，携带的重炮，接开炮掩护步军攻城。而骑兵则被掌握在手中，准备应对周边高丽的援军。本来被北辽连续三次征伐，在辽军打草谷习惯之下，高丽精兵损失惨重，国内壮丁也损失惨重。辽军军纪向来松懈，一向都是习惯一路进攻一路洗劫。两次征伐，高丽虽勉强守住了本土，但足足损失了十余万的丁壮。
在北辽三次征伐之中，开京被辽军付之一炬。此时的开京城墙，都还是用夯土临时堆成的，又哪里扛得住几十斤重炮轰击。没用半，城墙就被炸塌了十几丈。还没有等城内的高丽守军反应过来，齐军已经如潮水一般涌入了开京。惊慌失措的国君王询无奈，只能捧着国玺与册宝，与群臣出宫投降。见到这位国王骨气只持续了一上午，便举手投降，张德倒也干脆。
直接将高丽君臣，连同开京城内的高丽王公勋贵，文武诸臣并城中百姓，全部塞上了礼成江面的船只，调头送回中原。在拿下了开京后，张德又掉头南下。水师则同样沿着半岛南下，水陆并进向着半岛最南端，也是高丽王国龙兴之地的罗州而去。一路上张德，将蜗居在大理国数年的气，以及在山东路与杨继元训练水师受的气，全部发到了高丽诸地守军身上。
在听闻开京陷落，高丽君臣出城请降。原本在罗州征集壮丁的右常侍智蔡文，老臣姜邯赞，在南京汉城拥立王询第三子王徽为王。随即放弃了汉城，在汉京守军护卫下，向着罗州方向撤退。但还没有走多远，便被张德率领的马军追上。一阵厮杀下来，这两位在高丽与北辽作战之中，表现出色的老将没有再现辉煌，双双战死在汉京以南。至于那位新王当场则被俘。