于是，村上义清便派兵烧毁小诸城、大井城、岩尾城等地周边的民舍房屋，并且不断纵兵挑衅。
此举果然令镇守在佐久郡的武田信繁大为震怒，他当即命令曽根虎长（足轻大将）、诸角虎定、金丸虎嗣等人率一千余军势出城作战，意图歼灭这股来意不善的村上军。
村上义清得知留守在佐久郡的武田军果然按捺不住，派兵出城，当即率军回头，往鹿取川一带移动，假装因畏惧武田军而撤军。
曽根虎长、诸角虎定、金丸虎嗣等人不明所以，真以为是村上义清怯战，来不及多想就率军进行追击。
当武田军追击正在后撤的村上军到一半时，村上义清突然率军掉过头来，吹响法螺，命令麾下将士杀向武田军，两军遂在鹿取川一带展开激烈大战。在混战之中，村上义清更是亲自力战，接连斩杀十余名武田军武士。
尽管武田军死战不退，但因兵力少于村上军，最终村上军凌厉的攻势下被击溃了，武田军自曽根虎长、金丸虎嗣等人以下被讨取六百余人。诸角虎定见无法挽回败局后就收拢败军退往小诸城固守待援。
天文十六年，十月二十日。武田晴信无法容忍村上义清继续横行于北信浓诸郡，而决定再次从甲斐出阵，攻向小县郡。
五天后，武田晴信在与武田信繁、诸角虎定等家臣合流之后攻落倒向村上义清一方的和田城、武石城等地，将大井信定、羽田幸清等守将接连讨取。
在得知武田晴信亲自率军出阵小县郡的消息后，村上家重臣屋代政国、盐崎八郎、石川高清、室贺光氏、与依右近进、和田修理大夫、布下左卫门等人深知村上义清在无法获得越后上杉家方面有力支持的情况下是无法继续抵挡武田军的攻势，为了确保自己的家名存续，他们随即倒向了武田晴信，再次出仕武田家。不仅如此，他们还开始率军袭击村上军的小荷驮队，使得村上义清亲自坐镇的盐田城陷入了粮草短缺的境地。
村上义清在内无粮草外无救兵的情况下根本无法继续固守在盐田城，只能就此放弃退往葛尾城从长计议。武田军在夺取盐田城之后，武田晴信便任命重臣饭富虎昌为盐田城城代，以防此城再次被村上义清所夺取。
武田军并没就此停下脚步，反而还在不断北上，很快就席卷了整个小县郡。
仅仅一天一夜的功夫武田军就攻落十多座隶属于村上家的城池兵砦。同时，武田晴信还派遣乱波前往葛尾城下烧毁民舍房屋，以此来报鹿取川一战之仇。
趁着武田家无法在短时间内介入北信浓局势的机会，政虎则是着手开始攻打先前协助大熊朝秀、玉虫贞茂等人谋逆的市河信处。
越后上杉军在北信侍泉重岁、须田满国等人的引路下攻入市河家所领有的志久见乡，并且泉重岁还劝降了隶属于市河家的中曾根城城主中曾根道秋。
今井城城主今井经永非常畏惧越后上杉军，一听闻越后上杉军已经劝降了中曾根城，即将兵临城下的消息，就完全丧失了战意，当即弃城而逃。
而今井城的城兵在得知城主今井经永已经弃城逃往城坂城之后就不战自溃，很快今井城就被越后上杉军所占据。
越后上杉军在夺取中曾根城、今井城两地之后，又相继攻落了大泷城、上境城、西浦城等地，还讨取了市河家重臣大泷土佐守。市河信处见城坂城周边的支城皆已沦陷，无险可守，不得不放弃城坂城而退往市河家曾经的本据仙当城进行固守，同时派遣使者前往武田晴信处求援。