当畠山骏河守等人勾结加贺一向一揆众，并率大军攻入能登之后，能登四郡以及北射水郡不少匠作畠山家的家臣们都认为此次畠山义续凶多吉少，因此纷纷拥兵观望，坐视畠山骏河守等人围困七尾城。
等到清水原之战大捷的消息传来后，奥能登、北射水郡等地匠作畠山家家臣们纷纷率军前来与八条景定所率的上杉军合流。一时间，上杉·畠山联军势力大增。
此时七尾城已经解围，上杉·畠山联军遂乘胜长驱，接连扫平一向一揆军在七尾城外围所占领的城池兵砦。
就连畠山骏河守之前派出去运输粮草辎重的军势也全部被上杉·畠山联军一一歼灭。畠山骏河守等人见此情形，忧懑万分，又不知道该如何应对，只得每天数次向神佛祈祷，又不断的布施周边寺庙的僧人，希望自己能得到上天的保佑。
而此时此刻的一向一揆军则因为粮草将尽，开始渐渐分崩离析。先前畠山骏河守布置在羽咋郡、鹿岛郡各处要地的守军纷纷溃散逃离，争先恐后的往加贺方向逃亡。能登四郡的形势对于越后上杉家和匠作畠山家来说可谓是一片大好。
景定在切断一向一揆军的粮道之后则没有急着去攻打固守在胜山城的畠山骏河守等人，而是派遣内山满久率骑马武士们不断的袭扰胜山城内的守军，并且让轩辕众加藤段藏等人潜入城内烧毁胜山城城内的所有府库。这就使得胜山城内的一向一揆军上下皆是惶惶不可终日。
另一方面，从清水原死里逃生的畠山九郎可是非常清楚上杉军的战斗力，深知己方的这些由门徒众所组成的大军根本不是上杉军的对手，甚至还有了向匠作畠山家投降的想法。
与畠山九郎一同逃入胜山城里的残兵败将们也都在清水原上见识过上杉军那极其强悍的战斗力，在城内四处散播：“上杉军至矣，当避其锋！”
随着能登四郡的形势对一向一揆众愈发不利后，畠山骏河守自知难以与上杉·畠山联军继续抗衡，只能弃守胜山城撤回加贺重整旗鼓。
然而，畠山骏河守并不知道先前主动投降自己的末森城城主土肥但马守已被畠山义远所劝降，能登加贺两国的边境一带也被匠作畠山军完全封锁起来。
九月十五日，就当畠山骏河守、畠山胜禅寺、畠山九郎、下间赖清等人率仅剩的一万余门徒众离开胜山城，意图先退至羽咋郡的中川馆收拢败军从长计议。但是，他们在撤往中川馆的途中却被上杉·畠山联军所发现。
景定当即下令内山满久率四百五十余名骑马武士一路尾随追击一向一揆军，并且于原山赶至一向一揆军的前方，切断一向一揆军的前路。
同时，景定还率上杉·畠山联军一万六千余军势从一向一揆军的后方发起了猛攻，内山满久所率的骑马武士们则是从一向一揆军的正面发起突袭。其中，神保长职、神保氏张等越中神保一族的武将们表现极为活跃，他们深知此次若是作战不力的话很有可能连南射水郡的领地都会被越后上杉家所没收，故而皆身先士卒率部杀入一向一揆军阵中。
本就士气低落的一向一揆军在遭到上杉·畠山联军的两面夹击之下瞬间溃败，以至于相互践踏，十多里的范围内全是尸体，被讨取的多达三千余人。畠山骏河守、畠山胜禅寺、畠山九郎等人也都在乱军之中先后被讨取，而下间赖清则是孤身一人逃回了加贺。
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经此一役，加贺一向一揆众元气大伤。这也是加贺一向一揆众自九头龙川之战后又一次对外战事的惨败，就连本愿寺坊官下间家滴流的下间赖俊都在清水原一战中被上杉军所讨取。