共计三辆轒轀车，其中一辆因为辅兵保护不及时，还未挖掘进去就被城头守军摧毁，另外两辆成功爆破了城墙，炸开了l两处缺口，一处宽三丈二尺的缺口和一处宽两丈九尺的缺口。成功爆炸的两口大箱子内各有一百多斤火药，爆炸的效果还是不错的, 爆炸发生的时候，站在城头的叛军士兵感觉到脚下一阵剧烈的震动，人都站不稳了，纷纷摔倒。而在爆破点上方的守军更惨，爆炸过后，城墙上出现了两处斜坡，站在上面的守军尸骨无存。
“杀！”早已守候在城外的南京新军官兵们一声呐喊，朝着缺口处杀去。
反应过来的刘良佐声嘶力竭的大吼：“快, 上去，堵住缺口！”
回过神来的叛军立即组织人手，朝着缺口方向涌去，试图堵住缺口。可是他们还是慢了一步，南京新军抢先一步进入缺口，组成了密集的长枪阵，挡住缺口；火器兵迅速抢占了缺口两边的城墙，居高临下向叛军射击。
缺口处是一堵小小的斜坡，抢占了缺口的新军站在高地上，居高临下以长枪一次次的刺出，试图夺回缺口的叛军撞上长枪阵，大部分的人还没接近，就被密集的长枪刺成了筛子。少数叛军士兵进入了长枪阵内，贴近了新军长枪兵，但被长枪兵边上发刀牌手和斧枪兵所杀。
若是论个人武力，南京新军的这些士兵并没有经过多少个人武力的训练，单打独斗肯定不是刘良佐的那些老兵油子的对手，可是结阵而战, 南京新军却比刘良佐的那些乌合之众厉害多了。
举例子说明，一名南京新军的士兵肯定打不过一名刘良佐军的士兵；但十名南京新军的士兵肯定可以打得过十名刘良佐军的士兵；若是一百名南京新军的士兵，可以打得过两百名刘良佐军士兵，一千名南京新军士兵则可以打一万刘良佐军。
南京新军以西班牙方阵打退了企图夺回缺口的叛军士兵，锦衣新军的鸳鸯阵顶了上来，开始从缺口处往城内推进。
若是说西班牙方阵是最好的防御阵型的话，那么鸳鸯阵就是攻守兼备的阵型。其实西班牙方阵也能在推进中列阵攻击，只是那些士兵训练的时间比锦衣新军短，还无法做到在推进中阵型不乱，所以赵鹏对他们的要求只是结阵防御，进攻的任务就交给了锦衣新军。
锦衣新军进入城内，所遇见的叛军转眼崩溃。一支支鸳鸯阵推进过去，所过之处根本就没有敌人能够扛住一轮攻击。
守军已经彻底失去斗志了，两边攻打城墙的南京明军也爬上城头，迅速打开了城门，把更多的南京明军放入城内。
其实赵鹏对攻城的准备工作做得有些过剩了，这次攻城只用到了简易云梯、简易壕桥、望楼和轒轀车这几种攻城武器，大型云梯车、冲车和壕桥车都还没用上，城就被攻破了，这就显得准备工作过剩了。但赵鹏部那么以为，打仗的事情，宁可准备得过剩，也不能准备不足。
南京新军分别从缺口处和两边城墙攻入，三面攻入城内，城内的刘良佐和高杰军抵挡不住，准备开始跑路了。
“城破了！城破了！”城内的叛军惊恐地喊叫着，四散而逃。
仪真城北的城门大开，溃败的叛军一股脑从北面涌出，没命的往东和往北两个方向逃窜；刘良佐部往被逃窜，高杰部往东逃窜。